PGAP安裝筆記
2023 by RY Li PGAP github連結：https://github.com/ncbi/pgap/wiki
Read MoreMicrobial Genomics Core Laboratory, Graduate Institute of Genomics and Bioinformatics, NCHU, Taiwan
用遠端登入Ubuntu的時候，看到它說有一堆updates需要安裝： 在CLI中可以用以下的指令執行updates的安裝與維護： 備註：用SSH進去Mk1c也會看到這個，但我們對實驗設備一貫採取「能用就不要亂動」的原則，對於各種更新的安裝還是謹慎為上。
Read More基因體散彈槍定序的生物資訊工具很多，由於核酸定序的數據樣態隨著科技進步不斷改變，怎樣選擇這些生物資訊工具其實是個大問題。我們來試試這個CulebrONT，他可以用來運行各種的散彈槍定序組裝的生物資訊工具、修正(polishing)、甚至於(有必要的話)把序列圈起來等等，幫助你進行各種方案間的比較，讓使用者可以建構適合自己的理想工作流程，這篇是我們的安裝筆記。CulebrONT發表原文出處
Read MoreThis is a summary of the lecture content for the ourse ‘Shotgun Sequencing – Principle and Experiments’ in IGB, NCHU.
Read MoreWorking with CLI – What you need to know This is a summary of the lecture content for the course
Read MoreCertificate憑證過期所以不能用了！？
Read MoreUbuntu是一個蠻普及的Linux，我們平常都愛用它。官網上說，系統安裝有許多方式，包括下載鏡像欓(.iso)燒錄至DVD進行安裝。 它官網是這樣說的：“Either a DVD drive or a USB port for the installer media” ，但是呢… 我們下載要安裝的版本是Ubuntu 22.04.1 LTS，事實證明，燒錄的DVD碟並無法在研究室裡的任何一台有光碟機的工作站上順利完成開機進入安裝程序。 試行解決的方法：暫無 (三台不同的光碟機，舊電腦、新電腦都試過了，重新下載、再次validate檔案、降低燒錄速度重新燒錄都無效) 用USB快閃碟安裝是目前試過不會失敗的方法。
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