Nanopore的魚類圖鑑

大家知道一直以來我們做Nanopore Sequencing 會接觸到的許多軟體其實都是用魚的名字命名的嗎?(如果鯛魚燒也算的話)
原本只是作Nanopore定序,沒想到意外開啟了「魚類小圖鑑」之路。從長鰭鮪魚, 孔雀魚, 竹筴魚, 鬼頭刀到鯛魚(燒)等等,這些原本對我們做細菌的來說只是陌生的英文單字,現在竟然變成了熟悉的水中夥伴。誰會想到,一個做基因體生物資訊的人,最後記住魚的名字不是因為接觸魚類生態課,也不是釣魚,而是因為…軟體。學習的路上常常充滿意外的收穫,而這些魚的名字,也為我們在實驗室的工作多增添了幽默感和生命力。
Dorado: https://github.com/nanoporetech/dorado
Guppy: https://nanoporetech.com/software/other/guppy
Medaka: https://github.com/nanoporetech/medaka
Taiyaki: https://github.com/nanoporetech/taiyaki
… and more fish:
Comparison of Oxford Nanopore basecalling tools: https://github.com/gedoardo83/Nanopore_Basecalling-comparison