在Ubuntu安裝Unicycler

我們安裝了新的Ubuntu，然後在上面安裝unicycler。

作者：萬美秀

https://github.com/rrwick/Unicycler

其實照著Unicycler在github上的說明安裝就可以了，以下只是我們的筆記

我們已經事先裝好了anaconda，現在先創一個叫unicycler的環境：

conda create -n unicycler

進入這個‘unicycler’環境

conda activate unicycler

因為教學的需要，我們將unicycler安裝在/opt底下，所以先進到這個目錄

cd /opt

git clone是一個從網路上複製檔案的指令，如果你的電腦沒有安裝git，執行這行可能會出現安裝指示，依照指示使用apt安裝git就可以囉。另外，git clone是以使用者下指令時所在的目錄為目的地，萬一忘記先進到目標目錄，也可以事後再搬移。

git clone https://github.com/rrwick/Unicycler.git

進到/opt/Unicycler：

cd Unicycler

直接執行安裝指令的時候，會出現訊息請你使用sudo，所以就直接這樣裝了：

sudo python3 setup.py install

這樣會把unicycler安裝到/usr/local/bin/底下，接著使用者登入之後就可以進入conda的unicycler環境底下，然後打unicycler執行了：