微生物基因體核心研究室

Microbial Genomics Core Laboratory, Graduate Institute of Genomics and Bioinformatics, NCHU, Taiwan

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安裝Anaconda給大家用(Multi-user Anaconda installation)

Ubuntu的使用者user01自己安裝anaconda的話,它會裝到/home/user01/anaconda3去。但是我們也想讓裡面其他帳號的使用者都能用,怎麼做呢?我們的想法是建立一個叫做anaconda的群組,然後讓所有被加進這個群組的使用者們(user01, user02, user03, etc.) 都能在這台Linux上使用anaconda。

因為我們剛剛已經裝了一個只能給使用這自己用的anaconda,我們先解除使用者裝給自己的那個anaconda還有裡面不要的canda環境:

  1. 刪除/home/user01/anaconda
    rm -rf ~/anaconda
  2. 移除使用者 .bashrc 與 ~/.conda/environments.txt 裡面的相關的環境設定

取得Anaconda

https://www.anaconda.com下載Anaconda installer for Linux (我們裝的是64bit x86版本),下載來的是 Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh

安裝anaconda3

sudo sh Anaconda3-2024.02-1-Linux-x86_64.sh

指定安裝路徑:/opt/anaconda3

裝好之後,我們用groupadd指令,創立一個新的群組,名稱就叫做anaconda好了:

sudo groupadd anaconda

把/opt/anaconda包含裡面的東西都開放給anaconda群組使用:

sudo chgrp -R anaconda /opt/anaconda3
chmod 770 -R /opt/anaconda3

用adduser指令把使用者加進anaconda這個群組來:

sudo adduser user01 anaconda
sudo adduser user02 anaconda
…

備註:使用者可以同時隸屬於好幾個不同的群組,groupadd可以創立新群組,groupdel可以刪除群組。如果你要把使用者user03趕出anaconda群組,用deluser:
sudo deluser user03 anaconda

最後,使用者必須各自修改他的環境設定,才能用這個裝在opt底下的anaconda。

首先用source指令把activate這個script裡面設置Anaconda用的環境變數設置到使用者現在的shell

然後打conda init來初始化conda環境,它的用處是修改使用者的shell配置文件(這裡是.bashrc),以便每次啟動shell時都自動初始化conda:

source /opt/anaconda3/bin/activate
conda init

這會修改使用者自己的~/.bashrc 在裡面增加這樣的內容:

使用者必須登出再登入,以上一些設定才會生效喔!