微生物基因體研究室 Microbial Genomics Lab

Using genomics and bioinformatics to understand antimicrobial resistance, outbreaks, and emerging microbial threats

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Genotoxic Klebsiella pneumoniae in Taiwan

PLoS One. 2014 May 22;9(5):e96292. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24852749 研究在問什麼問題?在完成 Klebsiella pneumoniae 1084 的完整基因體定序後,我們注意到其染色體上存在一段結構與功能都相當不尋常的 genomic island。過去多項流行病學研究指出,K. pneumoniae 引起的肝膿瘍與宿主日後罹患癌症的風險之間存在統計上的關聯,但背後的生物學機制並不清楚。本研究關注的是,K. pneumoniae 是否可能透過特定基因體區段,對宿主細胞造成直接的 DNA 層級影響,進而提供一個潛在的解釋。 使用了什麼方法?我們首先在 K. pneumoniae 1084 的全基因體序列中,辨識出一段長約 208 kb

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